La FRMJC est agréée par l’Agence française du Programme Européen Jeunesse en Action (PEJA) en tant que "structure relais d’information, et d’accompagnement". Elle est devenue un véritable "centre ressource" pour le réseau régional MJC ; sa mission est d’informer, de conseiller, de soutenir et d’accompagner les jeunes et les animateurs afin de favoriser le développement quantitatif et qualitatif de projets européens.

Ses interventions favorisent le développement d’actions spécifiques en direction des jeunes telles que les échanges européens dans le cadre du PEJA, les échanges avec l’OFAJ, les initiatives de groupes, l’accueil et l’envoi de jeunes dans le cadre du PEJA, les échanges avec l’OFAJ, les initiatives de groupes, l’accueil et l’envoi de jeunes dans le cadre du SVE (Service Volontaire Européen), les rencontres inter régions, … En 2006, une vingtaine de MJC ont sollicité le secteur international pour la préparation de projets européens : Puisserguier, Narbonne, Marseillan, Lézignan, Coursan, Baillargues, Moussan, Carcassonne, Gruissan, Luc sur Orbieu, Narbonne Rural, Durban, Saint Laurent de la Cabrerisse, Mauguio …